Gabriel Bidaux

Post-doctorant, Lille 1
Equipe : Dynamique des réseaux biologiques (Laboratoire de Physique des Lasers, Atomes, Molécules)
Mél : gabriel.bidaux@univ-lille1.fr
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Descriptif :

Décryptage de la dynamique du complexe positive d’élongation de la transcription P-TEFb. Notre projet consiste en l’étude de la dynamique du complexe P-TEFb. Ce complexe induit la levée de la pause de la transcription et est nécessaire à la bonne processivité de la transcription ainsi que la coupure 3’ de l’ARN néo-synthétisé. Le complexe fonctionnel minimal P-TEFb est un dimère constitué d’une kinase, Cdk9, et d’une cycline, CT1, CT2A, CT2B ou CTK. Le complexe existe aussi sous un forme plus lourde dans laquelle 2 complexes P-TEFb sont associés avec un complexe 7SK constitué d’un ARN 7SK et des protéines Hexim1/2 et Larp7. Ce complexe 7SK peut, en absence de P-TEFb, se relocaliser dans les corps ribonucleoprotéiques. Les approches classiques de biochimies ont permit de relativement bien décrire les mécanismes d’interaction de ces différents partenaires, ainsi que d’offrir une large de gamme de mutants. Néanmoins, les données biophysiques décrivant la diffusion et l’association de P-TEFb avec l’ARN Pol II sont peu nombreuses. Grâce a des approches de photoniques alliant les mesures d’interactions (FRET), de diffusion (FCS, TICS, RICS) et de corrélation (FCCS, RICCS), nous nous sommes donné pour objectifs de décrire les processus dynamiques qui régissent l’activité de P-TEFb. Ce projet a pour but d’expliquer comment des molécules diffusant dans le nucléoplasme peuvent atteindre leurs cibles sur les sites actifs de transcription sans être en concentration saturante. Il a aussi pour objectif de relier les données structurales des protéines à leurs propriétés biophysiques régissant leur mouvement.

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