Thème 2007-2010: Molécule unique/ADN
Les interactions entre protéines et acides nucléiques sont souvent reliées à des déformations mécaniques des deux partenaires, mais les aspects dynamiques de ces déformations sont longtemps restés inconnus. La visualisation et la manipulation d’une molécule individuelle d’ADN permettent non seulement d’appréhender les propriétés mécaniques de la double hélice mais aussi de détecter en temps réel son interaction avec une molécule individuelle partenaire telle une protéine ou un acide nucléique. Il est ainsi possible d'évaluer simultanément les aspects structurels et cinétiques de l’interaction. La combinaison de ces informations permet l’étude du fonctionnement de nombreuses protéines et acides nucléiques tels les moteurs moléculaires (translocases, polymérases, topoisomérases...) ou les acides nucléiques structurés (ribozymes, cruciformes). Ce GDR établira un pôle de compétences en manipulation et visualisation d’acides nucléiques et/ou de protéines à l’échelle de la molécule individuelle. De nombreuses thématiques pourront être abordées dans le domaine des interactions entre ADN et protéines ou ADN et acides nucléiques, et en particulier la problématique de la régulation des structures des acides nucléique et l’impact de cette régulation sur l’expression des gènes.